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普通转录组
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简要概述
转录组包含一家细胞核、进行开展或动电线电缆或其他需要套屏蔽防波套的物体在特殊情形或情形下转录的几乎所有RNA偏序。转录组测序够着力快地收获某些种类特殊进行开展或人体系统在某些情形下的信使RNA(mRNA),并需要按量查重染色体展现出情况,知道新的转录本,分享染色体组成部分进化,已经正常识别染色体展现出调节无线网络,是反映染色体功能性和调节机制化的非常重要方法手段。
应用场景
01. 作物遗传改良
通过转录组差异分析,挖掘与产量、品质、抗逆性等重要农艺性状相关的基因。
02. 畜禽养殖
揭示畜禽生长发育的分子调控机制,挖掘与肉质、繁殖性能、抗病性等性状相关的基因。
03. 疾病研究与临床诊断
可以发现与疾病相关的差异表达基因,为疾病的早期诊断、治疗方案的制定以及预后评估提供新的靶点和策略。

技术优势
  • 提供全面的转录组信息
    就能够周全、一定量地测量生殖细胞、机构或生物工程体内很多转录本的抒发品质。
  • 发现新基因和基因可变剪切
    要显示新的什么是基因遗传相应什么是基因遗传的可调截取致死案。
  • 高灵敏度和准确性
    纵使关于非常低丰度的转录本也是可以参与为准查测,改善了研究方案的灵敏性度和为准性。
  • 适用于多种样本类型
    适用性于多样范本性质,展示 了更具有广泛性的理论研究物体和广泛应用解决方法。
技术流程
优秀案例
本钻研处理了435-7个转录组信息,对20个小尾寒羊安排安排的安排安排特女性朋友展示DNA(TSGs)确定了监定,会发现睾丸中TSG的量最常。钻研成员监定了小尾寒羊睾丸TSGs在小尾寒羊、绵羊肉和人类祖先互相的单纯性。收获了共要95-7个的高度单纯的TSG(HCTSG)、50九个轻中度单纯的DNA(MCTSG)和46个非单纯的TSG(NCTSG)。马上又对ASEDNA在小尾寒羊睾丸中的分散确定了钻研,过程滤、选择和批注后,在睾丸中收获共要644个ASEDNA,涉及到8九个安排安排特女性朋友ASE (TS-ASE)DNA(如FSIP2, TDRD9),许多ASEDNA和TS-ASEDNA都和小尾寒羊雄性男性生殖关于。
图1 RNA-Seq数据资料显示信息好的聚集内型聚类算法
图2 固执的睾丸TSG在精子形成中存在决定性功用
参考文献
Xu H, Zhang S, Duan Q, Lou M, Ling Y. Comprehensive analyses of 435 goat transcriptomes provides insight into male reproduction. Int J Biol Macromol. 2024;255:127942. doi:10.1016/j.ijbiomac.2023.127942
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