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产品介绍
中国大渔业海产品地理学研发院珠江渔业海产品研发所赵建研发员品牌与北京市康普森林业科技产业有限品牌品牌合作開發半个款是和于乌鳢的靶向疗法捕捉生物制种集成电路IC集成ic ——“乌鳢50K生物制种集成电路IC集成ic”。该集成电路IC集成ic其中包含了50K个高品质量高的SNPs位点,区域了与性取向重要性的特点位点,使用于乌鳢全人类基因组选用生物制种、新品上市种选育、消费者家系建立及系谱判定等核心研发。
厂品消息 重中之重性能参数 乌鳢50K选育处理芯片
标注信息 图标类 SNP
标出总额 50000
性别角色有关于位点 230
技术应用业务类型 康普森CAGT®靶向药物阻止测序技巧
测序群 河南、浙江省、江西、河北、山东、贵州、上海、甘肃等中北部乌鳢包括白乌鳢、金乌鳢
参考使用基因组组 GCA_033026475.1
应用方向
育种保种应用
全基因组选择育种
新品种培育
群体家系构建及系谱鉴定
基础研究
全基因组关联分析
选择信号分析
群体遗传进化分析
种质资源评估
数据表现
乌鳢50K育种芯片 — 染色体分布情况

图1 芯片位点在染色体上的分布图
乌鳢50K育种芯片 — MAF分布

图2 芯片位点MAF分布
乌鳢50K育种芯片 — 位点注释情况

图3 芯片位点注释情况

乌鳢50K育种芯片 — PCA比较分析

下图为根据群体原始基因型获得的PCA(左图),下图为根据芯片SNP位点获得的PCA(右图),样本聚集情况在二者中表现基本一致,说明该芯片可较好地代表群体原始状况。