简要概述
全表观遗传的组考虑(Genomic Selection,通称GS)选育可凭借搭配预计三维模型,依据表观遗传的组预计选育值(Genomic Estimated Breeding Value,
GEBV)去早期的个头的预计和考虑。优于于传统化的分子式标注辅助制作考虑选育,GS
选育就不需要去标注强势性考查,特殊适于于低遗传的力与不好检测的非常复杂物理性质。伴随着计算机系统科学的和测序技术水平的发展方向,GS就会有进那步取到广泛性应该用,将四轮驱动选育迈进4.0的时代。
合作案例
1.该项目材质:816份黄豆真正原于的不同于的地形气候渊源,涉及荷兰、西班牙、菲律宾等欧洲类种,国内新疆古、甘肃省、白山市省和白山市省等的不同于纬度经度中北部的 246 份种质成本和高大家族平衡品系。
2.DNA型统计资料:中豆芯1号检查测量。
3.分折模形:ABLUP、GBLUP 和 HBLUP 模形。
4.表型信息:花开花期(R1)、成长期期(R7),收获英文后检测法花园小区总产值(Yield)、百粒重(100-eedweight)、淀粉酶水分浓度(Protein)、肌肉水分浓度(0i)。
5.研发可是:本研发回收利用 5fold 相互检验,有点预侧解析 GEBV与表型的各种相关相互影响,可是体现了 GBLUP 步骤预侧解析最准度比较高,预侧解析特效均远高于 HBLUP、ABLUP,以系谱相互影响建设方案的 ABLUP
类别在各种遗传性状中的预侧解析最准度较低,足够验证了还可以回收利用中豆芯1号对大豆种展开原子繁育解析及预侧解析。
Rujian Sun, Liquan Qiu., et al. "Dissection of the practical soybean breeding pipeline by developing ZDX1, a
high-throughput functional array." Theor Appl Genet. 2022 Apr;135(4):1413-1427.