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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全表观dna组低角度重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是采取较低角度（~1×）的重测序大信息做出dna遗传病变种分几型，后续完成表观dna型安置，将高容重计算公式大信息安置为高容重计算公式表观dna型大信息。LcWGS 不必操作系统研发，测序成本费低，能够获利全表观dna组dna遗传病变种，更有助于大市场规模子样本的相对性状分析及 GS 选育软件应用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可换取全遗传病基因组的遗传病遗传变异
  • 高性价比
    以过低的测序成本费用较低低，提升高硬度的标注，检查转化率高
  • 大群体
    样本检测
    实采用大年龄层的DNA型论文检测及研究分析
  • 分型
    准确性高
    为添加百度算法，分析合理率会达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS遗传性状准确定位及GS导致较好
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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