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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全染色体组低深浅重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是运用较低深浅（~1×）的重测序大数据源分析开始表观隐性基因隐性基因变种表观隐性基因分型，完后利用染色体型选中，将低密计算公式大数据源分析选中为高黏度计算公式染色体型大数据源分析。LcWGS 免装置定制开发，测序费用低低，能够得到全染色体组表观隐性基因隐性基因变种，更有帮助于大型化样本量的特性确定及 GS 选育运用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可获取全基因遗传基因组的基因遗传遗传变异
  • 高性价比
    以非常低的测序费用低，赢得高容重的图标，测量速度高
  • 大群体
    样本检测
    适使用在于大行为的DNA型测量及研究方案
  • 分型
    准确性高
    应用场景填补百度算法，基因分型更准率能够达到98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS特性标记及GS数据十分
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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